Οι μαθητές της Β ΓΕΛ κατασκεύασαν μια σειρά από μόρια χημικών ενώσεων, χρησιμοποιώντας μοντέλα, τα οποία αποτελούνται από σφαίρες, μικρά ραβδάκια και λοβούς φτιαγμένα από πλαστικό. Οι σφαίρες παριστάνουν τα άτομα και έχουν διαφορετικά χρώματα και ορισμένο αριθμό οπών. Τα μοριακά μοντέλα είναι σχεδιασμένα για να αναπαριστούν δομές μορίων στον τρισδιάστατο χώρο. Η κατασκευή μοριακών μοντέλων είναι εξαιρετικά χρήσιμη για την κατανόηση της συντακτικής ισομέρειας.